ユニコーンとレオはラゴウが放ったウィルスに冒され、消滅の危機を迎えていた。ウィルスを除去するにはラゴウの体のサンプルを得て、データを解析するしかない。銀河と北斗は以前の戦いで切り落としたラゴウの足を回収するため、足が沈んでいる日本海溝へと向かう。

出雲銀河:松岡洋子／草薙北斗:進藤尚美／エリス・ウィラメット:鶴野恭子／アルテア:中田和宏／ベガ（草薙織絵）:三石琴乃／渋谷長官:西村知道／吉良国進:野島健児／スバル:鈴村健一／ガルファ皇帝:速水奨

原作:矢立肇／総監督:福田己津央／シリーズ構成:両澤千晶／キャラクターデザイン・総作画監督:久行宏和／メインメカニカルデザイン:ビークラフト、阿久津潤一／総メカ作画監督:重田智／音楽:佐橋俊彦

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